Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
KDM2AQ9Y2K7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
KDM2AQ9Y2K7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KDM2AQ9Y2K7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms