Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC50.45■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC50.45■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.45■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC50.44■■■■■ 5.67
NISCHQ9Y2I1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC50.43■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC50.43■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC50.43■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.43■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC50.43■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC50.42■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC50.41■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC50.41■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC50.41■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC50.41■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC50.41■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC50.41■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC50.4■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC50.4■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.4■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC50.4■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC50.4■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.4■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.39■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.39■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC50.39■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC50.39■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC50.39■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.38■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC50.38■■■■■ 5.66
NISCHQ9Y2I1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.37■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC50.37■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC50.36■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC50.36■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC50.36■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC50.36■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC50.35■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC50.35■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.35■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC50.34■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC50.34■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC50.34■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC50.33■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC50.33■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC50.32■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC50.32■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC50.32■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC50.31■■■■■ 5.65
NISCHQ9Y2I1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC50.31■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC50.3■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.3■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC50.3■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.29■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC50.29■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC50.29■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC50.28■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC50.28■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC50.28■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC50.27■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.27■■■■■ 5.64
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