Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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