Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGTPBP1Q9UPW5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms