Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA3Q9UL41 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA3Q9UL41 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms