Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSEQ9UL01 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSEQ9UL01 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms