Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPASTQ9UBP0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms