Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CC2D2AQ9P2K1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CC2D2AQ9P2K1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CC2D2AQ9P2K1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms