Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC88CQ9P219 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms