Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCHIP1Q9P0W5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCHIP1Q9P0W5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms