Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CABP1Q9NZU7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CABP1Q9NZU7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms