Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKIRAS2Q9NYR9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms