Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSD3Q9NYI0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSD3Q9NYI0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms