Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC3Q9NYG2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms