Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPP4R2Q9NY27 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP4R2Q9NY27 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms