Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
THUMPD1Q9NXG2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
THUMPD1Q9NXG2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
THUMPD1Q9NXG2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
THUMPD1Q9NXG2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
THUMPD1Q9NXG2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
THUMPD1Q9NXG2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
THUMPD1Q9NXG2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
THUMPD1Q9NXG2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THUMPD1Q9NXG2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms