Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM260Q9NX78 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM260Q9NX78 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms