Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD4Q9NVD3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SETD4Q9NVD3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms