Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTLC3Q9NUV7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTLC3Q9NUV7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms