Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM106BQ9NUM4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms