Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A11Q9NSA0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms