Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF4Q9NR80 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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