Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTN4Q9NQC3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms