Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRTAC1Q9NQ79 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAC1Q9NQ79 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms