Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL3Q9NQ33 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL3Q9NQ33 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms