Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
A4GALTQ9NPC4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
A4GALTQ9NPC4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms