Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCSER2Q9H7U1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER2Q9H7U1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms