Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R5

CENPH, Centromere protein H, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPHQ9H3R5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPHQ9H3R5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPHQ9H3R5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms