Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM5Q9C035 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms