Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXQ1Q9C009 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXQ1Q9C009 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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