Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROPN1BQ9BZX4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms