Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDEM3Q9BZQ6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM3Q9BZQ6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms