Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms