Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD1Q9BXT4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD1Q9BXT4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD1Q9BXT4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD1Q9BXT4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD1Q9BXT4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD1Q9BXT4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD1Q9BXT4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD1Q9BXT4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD1Q9BXT4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD1Q9BXT4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD1Q9BXT4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD1Q9BXT4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TDRD1Q9BXT4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD1Q9BXT4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD1Q9BXT4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD1Q9BXT4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD1Q9BXT4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD1Q9BXT4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD1Q9BXT4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD1Q9BXT4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD1Q9BXT4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD1Q9BXT4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD1Q9BXT4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD1Q9BXT4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms