Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP8

PAPPA2, Pappalysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA2Q9BXP8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPPA2Q9BXP8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPPA2Q9BXP8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms