Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP58Q9BVL2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms