Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PBDC1Q9BVG4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PBDC1Q9BVG4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms