Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB2BQ9BVA1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB2BQ9BVA1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms