Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KATNB1Q9BVA0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms