Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD1Q9BUP0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms