Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCMBPQ9BTE3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms