Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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