Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRACR2AQ9BSW2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2AQ9BSW2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms