Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARP6Q9BRS8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARP6Q9BRS8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms