Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
FYCO1Q9BQS8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FYCO1Q9BQS8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms