Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms