Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSF3RQ99062 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSF3RQ99062 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms