Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms