Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
IFT140Q96RY7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
IFT140Q96RY7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms