Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms